Công ty có chức năng nhiệm vụ chính là cung cấp sản phẩm dịch vụ công ích được UBND thành phố Hà Nội đặt hàng, góp phần thực hiện nhiệm vụ phát triển kinh tế xã hội của Thành phố, cụ thể như sau:
– Quản lý, khai thác, bảo vệ, duy trì hệ thống công trình thủy lợi; Tổ chức vận hành toàn bộ hệ thống công trình đáp ứng nhu cầu tưới cho diện tích đất sản xuất nông nghiệp, tiêu thoát nước cho diện tích đô thị, dân sinh, nông nghiệp, công nghiệp trên địa bàn liên quan đến các quận huyện: Đông Anh, Sóc Sơn, Gia Lâm, Thanh Trì, Nam Từ Liêm, Bắc Từ Liêm, Hoàng Mai, Long Biên và một số diện tích của các tỉnh lân cận, cung cấp nước thô cho sản xuất nước sinh hoạt.
– Nhiệm vụ phòng chống thiên tai: thực hiện chỉ đạo của Ban chỉ huy phòng chống thiên tai thành phố, phòng chống úng, ngập, hạn hán và lũ lụt trên địa bàn phục vụ; Phối hợp với Ban chỉ huy Phòng chống thiên tai và tìm kiếm cứu nạn các quận huyện, các xã phường thực hiện nhiệm vụ phòng chống thiên tai.